MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76

Total Repeats: 39579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010939	TAT	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149270
2	NC_010939	TTG	2	6	276	281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190149270
3	NC_010939	TCG	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190149270
4	NC_010939	T	6	6	331	336	0 %	100 %	0 %	0 %	190149270
5	NC_010939	CGG	2	6	384	389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190149270
6	NC_010939	TC	3	6	402	407	0 %	50 %	0 %	50 %	190149270
7	NC_010939	AGC	2	6	419	424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190149270
8	NC_010939	AGA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190149270
9	NC_010939	CAA	2	6	542	547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190149270
10	NC_010939	GGT	2	6	596	601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190149270
11	NC_010939	TTA	2	6	623	628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149270
12	NC_010939	CGGT	2	8	633	640	0 %	25 %	50 %	25 %	190149270
13	NC_010939	TGA	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149270
14	NC_010939	AAG	2	6	810	815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190149270
15	NC_010939	TAA	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190149270
16	NC_010939	ATT	2	6	872	877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149270
17	NC_010939	A	6	6	898	903	100 %	0 %	0 %	0 %	190149270
18	NC_010939	GAA	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190149270
19	NC_010939	TGA	2	6	999	1004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149270
20	NC_010939	AGA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190149270
21	NC_010939	A	6	6	1221	1226	100 %	0 %	0 %	0 %	190149270
22	NC_010939	ACA	2	6	1242	1247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190149270
23	NC_010939	TCGC	2	8	1290	1297	0 %	25 %	25 %	50 %	190149270
24	NC_010939	AAG	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190149270
25	NC_010939	ACA	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190149271
26	NC_010939	AGC	2	6	1566	1571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190149271
27	NC_010939	TAA	2	6	1592	1597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190149271
28	NC_010939	AGC	2	6	1761	1766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190149271
29	NC_010939	GAA	2	6	1782	1787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190149271
30	NC_010939	GTTA	2	8	1796	1803	25 %	50 %	25 %	0 %	190149271
31	NC_010939	ATTTA	2	10	1820	1829	40 %	60 %	0 %	0 %	190149271
32	NC_010939	TGAT	2	8	1918	1925	25 %	50 %	25 %	0 %	190149271
33	NC_010939	ACGG	2	8	2019	2026	25 %	0 %	50 %	25 %	190149271
34	NC_010939	TTA	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149271
35	NC_010939	GTGA	2	8	2130	2137	25 %	25 %	50 %	0 %	190149271
36	NC_010939	GT	3	6	2176	2181	0 %	50 %	50 %	0 %	190149271
37	NC_010939	GTG	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190149271
38	NC_010939	TGCG	2	8	2308	2315	0 %	25 %	50 %	25 %	190149271
39	NC_010939	GCGT	2	8	2344	2351	0 %	25 %	50 %	25 %	190149271
40	NC_010939	AAG	3	9	2401	2409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190149271
41	NC_010939	TGG	2	6	2524	2529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190149271
42	NC_010939	GCT	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190149271
43	NC_010939	CCG	2	6	2572	2577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190149271
44	NC_010939	AT	3	6	2936	2941	50 %	50 %	0 %	0 %	190149272
45	NC_010939	ATC	2	6	2958	2963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190149272
46	NC_010939	AAT	2	6	2964	2969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190149272
47	NC_010939	TC	3	6	2985	2990	0 %	50 %	0 %	50 %	190149272
48	NC_010939	TAATTT	2	12	3008	3019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149272
49	NC_010939	TTG	2	6	3054	3059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190149272
50	NC_010939	T	6	6	3067	3072	0 %	100 %	0 %	0 %	190149272
51	NC_010939	CGGT	2	8	3083	3090	0 %	25 %	50 %	25 %	190149272
52	NC_010939	ATT	2	6	3117	3122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149272
53	NC_010939	AGA	2	6	3134	3139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190149272
54	NC_010939	TGA	2	6	3161	3166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149272
55	NC_010939	GGTC	2	8	3181	3188	0 %	25 %	50 %	25 %	190149272
56	NC_010939	A	6	6	3198	3203	100 %	0 %	0 %	0 %	190149272
57	NC_010939	TTA	2	6	3309	3314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149272
58	NC_010939	TGCG	2	8	3511	3518	0 %	25 %	50 %	25 %	190149272
59	NC_010939	TTTTCG	2	12	3704	3715	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	190149272
60	NC_010939	TG	4	8	3772	3779	0 %	50 %	50 %	0 %	190149272
61	NC_010939	GAT	2	6	3843	3848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149272
62	NC_010939	CAA	2	6	3999	4004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190149272
63	NC_010939	TAAA	2	8	4016	4023	75 %	25 %	0 %	0 %	190149272
64	NC_010939	A	6	6	4021	4026	100 %	0 %	0 %	0 %	190149272
65	NC_010939	TGA	2	6	4083	4088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149273
66	NC_010939	CGC	2	6	4089	4094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190149273
67	NC_010939	ACCGCC	2	12	4108	4119	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	190149273
68	NC_010939	T	6	6	4195	4200	0 %	100 %	0 %	0 %	190149273
69	NC_010939	AAT	2	6	4250	4255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190149273
70	NC_010939	GTT	2	6	4302	4307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190149273
71	NC_010939	TTTC	2	8	4368	4375	0 %	75 %	0 %	25 %	190149273
72	NC_010939	TACCG	2	10	4480	4489	20 %	20 %	20 %	40 %	190149273
73	NC_010939	GTT	2	6	4518	4523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190149273
74	NC_010939	T	6	6	4564	4569	0 %	100 %	0 %	0 %	190149273
75	NC_010939	ATGATC	2	12	4570	4581	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149273
76	NC_010939	AAT	2	6	4613	4618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190149273
77	NC_010939	TTC	2	6	4932	4937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190149274
78	NC_010939	GAA	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190149274
79	NC_010939	A	7	7	5024	5030	100 %	0 %	0 %	0 %	190149274
80	NC_010939	ACGA	2	8	5067	5074	50 %	0 %	25 %	25 %	190149274
81	NC_010939	A	6	6	5204	5209	100 %	0 %	0 %	0 %	190149274
82	NC_010939	CGG	2	6	5228	5233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190149274
83	NC_010939	CGG	2	6	5267	5272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190149274
84	NC_010939	GGTGCG	2	12	5331	5342	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	190149274
85	NC_010939	CAT	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190149274
86	NC_010939	CCGA	2	8	5475	5482	25 %	0 %	25 %	50 %	190149274
87	NC_010939	ATT	2	6	5531	5536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149274
88	NC_010939	AGA	2	6	5555	5560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190149274
89	NC_010939	CAA	2	6	5582	5587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190149274
90	NC_010939	TG	3	6	5631	5636	0 %	50 %	50 %	0 %	190149274
91	NC_010939	A	6	6	5685	5690	100 %	0 %	0 %	0 %	190149274
92	NC_010939	ATT	2	6	5718	5723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149274
93	NC_010939	GCG	2	6	5724	5729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190149274
94	NC_010939	CGGT	2	8	5821	5828	0 %	25 %	50 %	25 %	190149274
95	NC_010939	ATT	2	6	5888	5893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149274
96	NC_010939	AAT	2	6	5941	5946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190149274
97	NC_010939	ATTT	2	8	6116	6123	25 %	75 %	0 %	0 %	190149275
98	NC_010939	AGTTT	2	10	6184	6193	20 %	60 %	20 %	0 %	190149275
99	NC_010939	AGT	2	6	6218	6223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149275
100	NC_010939	CCA	2	6	6233	6238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190149275
101	NC_010939	TTTC	2	8	6250	6257	0 %	75 %	0 %	25 %	190149275
102	NC_010939	CATA	2	8	6305	6312	50 %	25 %	0 %	25 %	190149275
103	NC_010939	GAT	2	6	6341	6346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149275
104	NC_010939	GTAC	2	8	6355	6362	25 %	25 %	25 %	25 %	190149275
105	NC_010939	TTCT	2	8	6363	6370	0 %	75 %	0 %	25 %	190149275
106	NC_010939	ACG	2	6	6411	6416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190149275
107	NC_010939	ACCG	2	8	6462	6469	25 %	0 %	25 %	50 %	190149275
108	NC_010939	GA	3	6	6524	6529	50 %	0 %	50 %	0 %	190149275
109	NC_010939	CGT	2	6	6557	6562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190149275
110	NC_010939	CCG	2	6	6652	6657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190149275
111	NC_010939	TAA	2	6	6729	6734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190149275
112	NC_010939	GTTT	2	8	6769	6776	0 %	75 %	25 %	0 %	190149275
113	NC_010939	GTT	2	6	6962	6967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190149275
114	NC_010939	TTTA	2	8	7011	7018	25 %	75 %	0 %	0 %	190149275
115	NC_010939	T	7	7	7193	7199	0 %	100 %	0 %	0 %	190149275
116	NC_010939	A	7	7	7352	7358	100 %	0 %	0 %	0 %	190149276
117	NC_010939	CTC	2	6	7363	7368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190149276
118	NC_010939	CGT	2	6	7578	7583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190149276
119	NC_010939	TTTAA	2	10	7650	7659	40 %	60 %	0 %	0 %	190149276
120	NC_010939	GAA	2	6	7665	7670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190149276
121	NC_010939	AGCG	2	8	7679	7686	25 %	0 %	50 %	25 %	190149276
122	NC_010939	CATT	2	8	7697	7704	25 %	50 %	0 %	25 %	190149276
123	NC_010939	TTGG	2	8	7935	7942	0 %	50 %	50 %	0 %	190149276
124	NC_010939	GCG	2	6	7989	7994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190149276
125	NC_010939	ACA	2	6	8006	8011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190149276
126	NC_010939	GAT	2	6	8138	8143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149276
127	NC_010939	GCG	2	6	8145	8150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190149276
128	NC_010939	CGG	2	6	8176	8181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190149276
129	NC_010939	TTGG	2	8	8246	8253	0 %	50 %	50 %	0 %	190149276
130	NC_010939	AT	3	6	8276	8281	50 %	50 %	0 %	0 %	190149276
131	NC_010939	TTA	2	6	8295	8300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149276
132	NC_010939	AATT	2	8	8323	8330	50 %	50 %	0 %	0 %	190149276
133	NC_010939	ATT	2	6	8374	8379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149276
134	NC_010939	GAT	2	6	8385	8390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149276
135	NC_010939	AAC	2	6	8422	8427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190149276
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137	NC_010939	GAAA	2	8	8563	8570	75 %	0 %	25 %	0 %	190149277
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